Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TNXAQ16473 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TNXAQ16473 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNXAQ16473 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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