Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GABRA6Q16445 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms