Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC1A5Q15758 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC1A5Q15758 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms