Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRADDQ15628 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRADDQ15628 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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