Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TAF1AQ15573 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TAF1AQ15573 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms