Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1CQ15572 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1CQ15572 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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