Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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