Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SF3B3Q15393 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SF3B3Q15393 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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