Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRKQ15262 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRKQ15262 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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