Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PCM1Q15154 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PCM1Q15154 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PCM1Q15154 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCM1Q15154 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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