Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PRKD1Q15139 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PRKD1Q15139 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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