Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLD3Q15054 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLD3Q15054 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms