Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRAM2Q15035 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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