Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GPNMBQ14956 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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