Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSPNQ14714 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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