Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IHHQ14623 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IHHQ14623 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
IHHQ14623 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IHHQ14623 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IHHQ14623 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IHHQ14623 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms