Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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GBX1Q14549 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GBX1Q14549 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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