Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SCARB2Q14108 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCARB2Q14108 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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