Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB33AQ14088 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB33AQ14088 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms