Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SHROOM2Q13796 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
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SHROOM2Q13796 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SHROOM2Q13796 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
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