Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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