Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ATP1A4Q13733 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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