Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAPSNQ13702 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms