Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMAD4Q13485 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMAD4Q13485 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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