Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ASAH1-247ENST00000637429 2558 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 RCCD1-209ENST00000557750 1696 ntTSL 314.36□□□□□ -0.113e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 USP36-223ENST00000592326 406 ntTSL 513.89□□□□□ -0.193e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-202ENST00000314146 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.333e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 312.33□□□□□ -0.443e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-226ENST00000636435 4611 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 C1orf52-201ENST00000294661 3391 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.623e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-229ENST00000636537 1056 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.693e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-225ENST00000636299 543 ntTSL 410.64□□□□□ -0.713e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-234ENST00000636715 1025 ntTSL 59.87□□□□□ -0.833e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-248ENST00000637484 2304 ntTSL 59.64□□□□□ -0.873e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-213ENST00000523744 5740 nt9.06□□□□□ -0.963e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-227ENST00000636455 1777 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-260ENST00000637805 780 ntTSL 57.84□□□□□ -1.153e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-256ENST00000637718 662 ntTSL 57.77□□□□□ -1.173e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.193e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.193e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-237ENST00000636823 571 ntTSL 47.46□□□□□ -1.223e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-238ENST00000636828 3365 ntTSL 25.89□□□□□ -1.473e-8■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 ASAH1-208ENST00000519545 771 ntTSL 34.53□□□□□ -1.683e-8■■■■□ 22.1
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PABPC4Q13310 RPS29-205ENST00000556230 624 ntTSL 1 (best)9.3□□□□□ -0.927e-46■■■■□ 22.1
PABPC4Q13310 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.144e-11■■■■□ 22.1
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PABPC4Q13310 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.571e-323■■■■□ 22
PABPC4Q13310 PABPC1-222ENST00000523555 522 ntTSL 311.38□□□□□ -0.591e-323■■■■□ 22
PABPC4Q13310 MINOS1-207ENST00000486890 677 ntTSL 315.09■□□□□ 0.014e-11■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 ACY1-220ENST00000637149 386 ntTSL 315.01□□□□□ -0.011e-10■■■■□ 22
PABPC4Q13310 CCT4-203ENST00000461540 638 ntTSL 34.79□□□□□ -1.647e-8■■■■□ 22
PABPC4Q13310 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.227e-8■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.967e-8■■■■□ 22
PABPC4Q13310 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.044e-8■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 KANSL2-209ENST00000548701 922 ntTSL 312.06□□□□□ -0.484e-11■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 KANSL2-203ENST00000547087 831 ntTSL 37.64□□□□□ -1.194e-11■■■■□ 22
PABPC4Q13310 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 29.2□□□□□ -0.944e-45■■■■□ 22
PABPC4Q13310 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.681e-27■■■■□ 22
PABPC4Q13310 YIF1A-209ENST00000494836 540 ntTSL 219.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 22
PABPC4Q13310 YIF1A-208ENST00000485820 653 ntTSL 217.97■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 22
PABPC4Q13310 YIF1A-211ENST00000526497 516 ntTSL 517.52■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22
PABPC4Q13310 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.173e-8■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 MYL6-210ENST00000548400 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-14■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 NANS-204ENST00000461452 3027 ntTSL 212.56□□□□□ -0.47e-7■■■■□ 22
PABPC4Q13310 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.642e-26■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.582e-8■■■■□ 22
PABPC4Q13310 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.432e-8■■■■□ 22
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PABPC4Q13310 RPL10A-202ENST00000464112 1063 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.124e-34■■■■□ 22
PABPC4Q13310 RPL10A-201ENST00000322203 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-34■■■■□ 22
PABPC4Q13310 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.279e-7■■■■□ 21.9
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PABPC4Q13310 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.031e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ERP29-201ENST00000261735 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-208ENST00000601865 646 ntTSL 223.87■■□□□ 1.412e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 PAFAH1B3-207ENST00000599778 380 ntTSL 515.08■□□□□ 02e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ASAP3-204ENST00000465372 936 ntTSL 519.58■□□□□ 0.723e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 ASAP3-208ENST00000492982 3024 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-8■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NUBP2-207ENST00000565603 995 ntTSL 323.28■■□□□ 1.322e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 LIMK1-202ENST00000418310 3360 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.691e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.071e-14■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.981e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-203ENST00000528087 1701 ntTSL 221.07■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.731e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-210ENST00000534515 1793 ntTSL 218.46■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 21.9
PABPC4Q13310 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 21.9
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