Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLAMF1Q13291 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLAMF1Q13291 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms