Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPA4Q13156 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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