Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MRPL28Q13084 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRPL28Q13084 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms