Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK2Q13002 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms