Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXD4Q12950 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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