Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPSF1Q10570 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms