Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CGNL1Q0VF96 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CGNL1Q0VF96 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms