Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C2orf54Q08AI8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C2orf54Q08AI8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms