Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LGALS3BPQ08380 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LGALS3BPQ08380 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms