Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms