Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RAD51Q06609 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms