Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DEUP1Q05D60 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DEUP1Q05D60 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms