Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A2Q05940 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms