Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GRIN1Q05586 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIN1Q05586 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms