Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPN12Q05209 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPN12Q05209 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms