Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EMX2Q04743 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EMX2Q04743 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms