Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TLE4Q04727 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLE4Q04727 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms