Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
IRF8Q02556 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms