Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DSC2Q02487 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms