Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN2Q02246 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms