Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNFRSF17Q02223 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms