Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BEX3Q00994 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BEX3Q00994 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms