Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1BQ00975 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACNA1BQ00975 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms