Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms