Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK3Q00526 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK3Q00526 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms